Будучи епископом Сардийской Церкви, он, как истинный пастырь, ревностно просвещал святой верой язычников и многих из них обратил ко Христу, за что при Валериане (правителе Сардийском, по др. источникам — Римском правителе), претерпел жестокие мучения.
Святого страдальца сначала ввергли в темницу, где долгое время он был томим голодом и жаждой, а затем стали переводить с одного места на другое, подвергая жестоким мучениям в Синаоне, Анкире, Лидии. В одном месте, при реке Астале, святителя распростерли крестообразно, привязав к сухим кольям, и предали жестокому бичеванию. Земля напиталась кровью мученика, сухие колья пустили ростки и произрастили ветви и листья, а затем выросли в большие деревья, листьями которых исцелялись различные недуги.
После многих мучений святитель Ферапонт был умерщвлен в Лидии, близ реки Гермуса.