Подвизался в Вифинии, в Мидикийском монастыре. По любви к иночеству он, тайно оставив родительский дом, ушел в монастырь и за это претерпел от своего отца жестокое наказание, но потом, с его изволения, снова вернулся в обитель.
Преподобный Афанасий был сподвижником и собеседником преподобного Никиты и скончался около 814 г. На его могиле выросло кипарисовое дерево, от которого по благодати Божией приходящие получали исцеления.