Была старшей дочерью греческого анфипата Анфимия. Отказавшись выйти замуж и решив посвятить свою жизнь Богу, святая предприняла путешествие в Иерусалим, а затем в Александрию. По пути, отпустив всех рабов, она тайно переоделась в мужскую монашескую одежду и поселилась в пустыне при болоте.
Через несколько лет св. Аполлинария по откровению свыше вышла из затвора и поселилась в мужском скиту под именем Дорофей. Получив от Бога благодать исцеления недугов, изгнала из своей родной сестры беса. Но он снова вошел в нее и дал ей вид зачавшей женщины, оклеветав при этом блаженного Дорофея. Тогда святая открыла свою тайну родителем своим и второй раз излечила свою сестру.
Вернувшись затем в скит, она через некоторое время преставилась ко Господу, и только тогда братия увидела, что Дорофей — это женщина. От святых мощей преподобной Аполлинарии совершались многие исцеления.